Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCNB1IP1Q9NPC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms