Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
VAT1LQ9HCJ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VAT1LQ9HCJ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms