Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POPDC2Q9HBU9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms