Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP1Q9BWH6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RPAP1Q9BWH6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms