Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENOOQ9BVL4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms