Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms