Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREX2Q9BQ50 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms