Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPAT1Q99943 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPAT1Q99943 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms