Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCHS1Q96JQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms