Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT2BQ96GJ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms