Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1AQ96CP6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms