Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF18Q96CE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms