Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF3C6Q969F1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms