Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRF1Q92994 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRF1Q92994 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms