Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASKIN2Q8WXE0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASKIN2Q8WXE0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms