Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUFY2Q8WXA3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RUFY2Q8WXA3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms