Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY5

CREB3L4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L4Q8TEY5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CREB3L4Q8TEY5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L4Q8TEY5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L4Q8TEY5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms