Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSH3Q8TE77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms