Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1783.4 ms