Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SVOPQ8N4V2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SVOPQ8N4V2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms