Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4DQ86TL0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms