Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1LQ7Z5L2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HCC1LQ7Z5L2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
R3HCC1LQ7Z5L2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms