Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP54Q7Z3B4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP54Q7Z3B4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms