Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2BQ7L1I2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2BQ7L1I2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms