Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDZRN4Q6ZMN7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN4Q6ZMN7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms