Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REP15Q6BDI9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms