Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SOGA3Q5TF21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOGA3Q5TF21 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms