Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAP1Q5SW96 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDLRAP1Q5SW96 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms