Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD3Q5JSP0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms