Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LONRF3Q496Y0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LONRF3Q496Y0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms