Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

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Length 735 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX4Q33E94 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX4Q33E94 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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