Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD2Q16342 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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