Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRADDQ15628 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRADDQ15628 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms