Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBFBQ13951 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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