Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF2Q12933 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms