Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 UBA3YPR066W 900 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 LDH1YBR204C 1128 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YBR226CYBR226C 411 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YPT10YBR264C 600 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 UBP13YBL067C 2244 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 PSA1YDL055C 1086 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 POP6YGR030C 477 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 NTR2YKR022C 969 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 CMS1YLR003C 876 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 MRPS17YMR188C 714 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YBL062WYBL062W 381 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 CPR8YNR028W 927 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 MED8YBR193C 672 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 APA1YCL050C 966 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 IES1YFL013C 2079 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YEL023CYEL023C 2049 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 ECM27YJR106W 2178 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 FCP1YMR277W 2199 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 SRF1YDL133W 1314 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 RMD1YDL001W 1293 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 PRI1YIR008C 1230 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YJL171CYJL171C 1191 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 IRC25YLR021W 540 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 REH1YLR387C 1299 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YOL106WYOL106W 354 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 IRC11YOR013W 471 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YPL191CYPL191C 1083 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YPR142CYPR142C 564 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 ECM18YDR125C 1362 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 HXT13YEL069C 1695 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 GUS1YGL245W 2127 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 SLS1YLR139C 1932 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 RDR1YOR380W 1641 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 ALB1YJL122W 528 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 PML1YLR016C 615 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 SWD1YAR003W 1281 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YPL014WYPL014W 1146 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 PTR2YKR093W 1806 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 ATG18YFR021W 1503 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 VHS1YDR247W 1386 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 MSS116YDR194C 1995 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YDR249CYDR249C 1122 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 MHR1YDR296W 681 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 IRC6YFR043C 714 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 CTR2YHR175W 570 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 IRC9YJL142C 393 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 RPC25YKL144C 639 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YLR456WYLR456W 615 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 SNN1YNL086W 309 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 GPM3YOL056W 912 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 DSC3YOR223W 879 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 PEX32YBR168W 1242 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 PSP2YML017W 1782 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 PNS1YOR161C 1620 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 ADA2YDR448W 1305 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SAD1YFR005C 1347 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 TFC7YOR110W 1308 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 CDC7YDL017W 1524 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 HHY1YEL059W 309 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 TOM40YMR203W 1164 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 INP1YMR204C 1263 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YOR342CYOR342C 960 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 TAF3YPL011C 1062 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 CNS1YBR155W 1158 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 RPL21AYBR191W 483 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 MAK11YKL021C 1407 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 GPM2YDL021W 936 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 MNN10YDR245W 1182 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YGR016WYGR016W 573 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SFK1YKL051W 1062 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 GMH1YKR030W 822 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 CPT1YNL130C 1182 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 RCR1YBR005W 642 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YPR071WYPR071W 636 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 COR1YBL045C 1374 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SEC23YPR181C 2307 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 GUT1YHL032C 2130 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 EFM1YHL039W 1758 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 CEG1YGL130W 1380 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 TFG2YGR005C 1203 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 HST2YPL015C 1074 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 ERV2YPR037C 591 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 KIN1YDR122W 3195 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 PGI1YBR196C 1665 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 GDA1YEL042W 1557 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 ELP4YPL101W 1371 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 DMC1YER179W 1005 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 HAC1YFL031W 717 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 PEX14YGL153W 1026 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 RRF1YHR038W 693 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YKL169CYKL169C 384 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YLR156WYLR156W 345 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YLR159WYLR159W 345 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YLR161WYLR161W 345 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 DOM34YNL001W 1161 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SUN4YNL066W 1263 nt6.49□□□□□ -1.37
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