Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFFO1Q0D2I5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms