Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 STM1YLR150W 822 nt6.42□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 KNS1YLL019C 2214 nt6.42□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 YME1YPR024W 2244 nt6.42□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 HIS7YBR248C 1659 nt6.42□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 HSP78YDR258C 2436 nt6.41□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 ADY2YCR010C 852 nt6.41□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 TOM20YGR082W 552 nt6.41□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 RPL10YLR075W 666 nt6.41□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 TAL1YLR354C 1008 nt6.41□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 YFR006WYFR006W 1608 nt6.4□□□□□ -1.38
DSE3Q08729 VPS4YPR173C 1314 nt6.4□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 NOG2YNR053C 1461 nt6.4□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 COX9YDL067C 180 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 EFM4YIL064W 774 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 EHD3YDR036C 1503 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 YKR023WYKR023W 1593 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 VNX1YNL321W 2727 nt6.38□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 QNS1YHR074W 2145 nt6.38□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 GFA1YKL104C 2154 nt6.38□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 BRL1YHR036W 1416 nt6.37□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 SCO2YBR024W 906 nt6.37□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 ATP4YPL078C 735 nt6.37□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 MRPL36YBR122C 534 nt6.37□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.37□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.36□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 ARG1YOL058W 1263 nt6.36□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 HCR1YLR192C 798 nt6.35□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 ALT2YDR111C 1524 nt6.35□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 GIR2YDR152W 798 nt6.34□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 FAF1YIL019W 1041 nt6.34□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 ATF1YOR377W 1578 nt6.34□□□□□ -1.39
DSE3Q08729 PYC1YGL062W 3537 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 HXT17YNR072W 1695 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 YML6YML025C 861 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 MLC2YPR188C 492 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 HXK2YGL253W 1461 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.32□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 YEH1YLL012W 1722 nt6.31□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 PPM1YDR435C 987 nt6.31□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 SMF2YHR050W 1650 nt6.3□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 YDR514CYDR514C 1452 nt6.3□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 ARP2YDL029W 1176 nt6.3□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 COX26YDR119W-A 201 nt6.3□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 GFD1YMR255W 567 nt6.3□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 STB5YHR178W 2232 nt6.3□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 HXT2YMR011W 1626 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 BNS1YGR230W 414 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 MRPL13YKR006C 795 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 PUS5YLR165C 765 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 YLR194CYLR194C 765 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 REC114YMR133W 1287 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 ELA1YNL230C 1140 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 DAL82YNL314W 768 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 YDL034WYDL034W 345 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 PIN2YOR104W 849 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 YAP1801YHR161C 1914 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 BUL1YMR275C 2931 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 POP1YNL221C 2628 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE3Q08729 YBR284WYBR284W 2394 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 SNZ3YFL059W 897 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 YGR176WYGR176W 348 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 SYN8YAL014C 768 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 COS9YKL219W 1224 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 PGA3YML125C 939 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 SNZ2YNL333W 897 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 MID1YNL291C 1647 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 NSE5YML023C 1671 nt6.26□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 NUD1YOR373W 2556 nt6.26□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 YDL057WYDL057W 987 nt6.26□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 VPS5YOR069W 2028 nt6.26□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 AVT4YNL101W 2142 nt6.26□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 SHE10YGL228W 1734 nt6.25□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 CAD1YDR423C 1230 nt6.25□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 RPS15YOL040C 429 nt6.25□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 RBD2YPL246C 789 nt6.25□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 ATP1YBL099W 1638 nt6.24□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 KDX1YKL161C 1302 nt6.24□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 GUA1YMR217W 1578 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 PAT1YCR077C 2391 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 RTT106YNL206C 1368 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 QDR3YBR043C 2070 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 RPL7AYGL076C 735 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 YGR127WYGR127W 939 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 PGU1YJR153W 1086 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 YLL059CYLL059C 507 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 CAR1YPL111W 1002 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE3Q08729 RPL7BYPL198W 735 nt6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.9 ms