Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 GAT1YFL021W 1533 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 PWP1YLR196W 1731 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 YDR015CYDR015C 240 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 RPN11YFR004W 921 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 NHP6BYBR089C-A 300 nt4.98□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 HVG1YER039C 750 nt4.97□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 HAP2YGL237C 798 nt4.97□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 YPL136WYPL136W 369 nt4.97□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 MCM3YEL032W 2916 nt4.97□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 ICL1YER065C 1674 nt4.96□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 PYC1YGL062W 3537 nt4.96□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 ATG4YNL223W 1485 nt4.96□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 VRP1YLR337C 2454 nt4.96□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 OPI7YDR360W 435 nt4.96□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 PHM8YER037W 966 nt4.96□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YER186CYER186C 921 nt4.96□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YJL193WYJL193W 1209 nt4.96□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YJU3YKL094W 942 nt4.96□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 RRT2YBR246W 1164 nt4.96□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 RAD3YER171W 2337 nt4.95□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YDL023CYDL023C 321 nt4.95□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 TRP1YDR007W 675 nt4.95□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 MSP1YGR028W 1089 nt4.95□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YKL223WYKL223W 333 nt4.95□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 PDR16YNL231C 1056 nt4.95□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 HSP78YDR258C 2436 nt4.95□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 MCX1YBR227C 1563 nt4.95□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 UTP9YHR196W 1728 nt4.94□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 RRN3YKL125W 1884 nt4.94□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YNL095CYNL095C 1929 nt4.94□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 EPS1YIL005W 2106 nt4.94□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 KEX2YNL238W 2445 nt4.94□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 VAN1YML115C 1608 nt4.94□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 GSY2YLR258W 2118 nt4.93□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YDL218WYDL218W 954 nt4.93□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YER148W-AYER148W-A 579 nt4.93□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt4.93□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 MDH1YKL085W 1005 nt4.93□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YPK2YMR104C 2034 nt4.93□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 AVO1YOL078W 3531 nt4.93□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 RRP9YPR137W 1722 nt4.93□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 ELP2YGR200C 2367 nt4.93□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 MNN2YBR015C 1794 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 SUP19tS(UGA)E 82 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 SUP17tS(UGA)I 82 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 SUP16tS(UGA)P 82 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 DRE2YKR071C 1047 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 TAL1YLR354C 1008 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YMR295CYMR295C 594 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 RAD24YER173W 1980 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 NOP2YNL061W 1857 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 ERC1YHR032W 1746 nt4.92□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 ISN1YOR155C 1353 nt4.91□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YDL129WYDL129W 876 nt4.91□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 RPS2YGL123W 765 nt4.91□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 SEC17YBL050W 879 nt4.91□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YNL285WYNL285W 372 nt4.91□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 YOL131WYOL131W 327 nt4.91□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 CYK3YDL117W 2658 nt4.91□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 BUD9YGR041W 1644 nt4.9□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 MID1YNL291C 1647 nt4.9□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 DBF4YDR052C 2115 nt4.9□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 EXO1YOR033C 2109 nt4.9□□□□□ -1.62
HRD1Q08109 RME1YGR044C 903 nt4.9□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 DBP8YHR169W 1296 nt4.9□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 FSF1YOR271C 984 nt4.9□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 ECM33YBR078W 1290 nt4.9□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 OPT1YJL212C 2400 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 DIA3YDL024C 1407 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YME1YPR024W 2244 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 DSF1YEL070W 1509 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YNR073CYNR073C 1509 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 IDP1YDL066W 1287 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 CHO1YER026C 831 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 LEU5YHR002W 1074 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 JNM1YMR294W 1122 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YNL019CYNL019C 855 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YNL033WYNL033W 855 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 RNH201YNL072W 924 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 ATP1YBL099W 1638 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 TFC6YDR362C 2019 nt4.89□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YRF1-4YLR466W 4149 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 NTH2YBR001C 2343 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 DJP1YIR004W 1299 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 RPO26YPR187W 468 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 OCA5YHL029C 2040 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 RBA50YDR527W 1320 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 DFG5YMR238W 1377 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 CLB1YGR108W 1416 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 SIT1YEL065W 1887 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 SIP5YMR140W 1470 nt4.88□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 ATE1YGL017W 1512 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YMR155WYMR155W 1644 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 PPR1YLR014C 2715 nt4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.1 ms