Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBE1Q04446 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBE1Q04446 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms