Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 YHL017WYHL017W 1599 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 HVG1YER039C 750 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YHL018WYHL018W 363 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 RPR2YIR015W 435 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YJL171CYJL171C 1191 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 EFM3YJR129C 1020 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 GCV3YAL044C 513 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 ECM31YBR176W 939 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 LDB16YCL005W 771 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 VPS5YOR069W 2028 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 HIR1YBL008W 2523 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 ERG7YHR072W 2196 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 HOS1YPR068C 1413 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 ERG1YGR175C 1491 nt5.39□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YLL067CYLL067C 3618 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 UGO1YDR470C 1509 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 CRZ1YNL027W 2037 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YDR396WYDR396W 501 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 MPM1YJL066C 759 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YJR084WYJR084W 1272 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 MRP51YPL118W 1035 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 VTH1YIL173W 4650 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 VTH2YJL222W 4650 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YML133CYML133C 4125 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 RVB2YPL235W 1416 nt5.38□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 NUP1YOR098C 3231 nt5.37□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 IPK1YDR315C 846 nt5.37□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 QNS1YHR074W 2145 nt5.37□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 PRE3YJL001W 648 nt5.37□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 GLC8YMR311C 690 nt5.37□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 TSR3YOR006C 942 nt5.37□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 EIS1YMR031C 2532 nt5.37□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 NSI1YDR026C 1713 nt5.37□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YIL092WYIL092W 1902 nt5.36□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 RAD59YDL059C 717 nt5.36□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 SDH4YDR178W 546 nt5.36□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 MEH1YKR007W 555 nt5.36□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 RRT7YLL030C 342 nt5.36□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 ZRT2YLR130C 1269 nt5.36□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 IES2YNL215W 963 nt5.36□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 DAP1YPL170W 459 nt5.36□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 PEX3YDR329C 1326 nt5.36□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 MET7YOR241W 1647 nt5.35□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 PPT1YGR123C 1542 nt5.35□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YIR042CYIR042C 711 nt5.35□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 PSR2YLR019W 1194 nt5.35□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 AAT2YLR027C 1257 nt5.35□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 CWC25YNL245C 540 nt5.35□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 PHA2YNL316C 1005 nt5.35□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 RPS28AYOR167C 204 nt5.35□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 TAH18YPR048W 1872 nt5.34□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 ACC1YNR016C 6702 nt5.34□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 CRF1YDR223W 1404 nt5.34□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 PML1YLR016C 615 nt5.34□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 YMR147WYMR147W 672 nt5.34□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 XBP1YIL101C 1944 nt5.34□□□□□ -1.55
SKO1Q02100 PAT1YCR077C 2391 nt5.34□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 HOS2YGL194C 1359 nt5.33□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 GEP5YLR091W 882 nt5.33□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 FOB1YDR110W 1701 nt5.33□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 CCZ1YBR131W 2115 nt5.33□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 DIT1YDR403W 1611 nt5.33□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 CNE1YAL058W 1509 nt5.33□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 NOP2YNL061W 1857 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 PRY3YJL078C 2646 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 LYS21YDL131W 1323 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 STE13YOR219C 2796 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 TMT1YER175C 900 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 YIR043CYIR043C 693 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 MOG1YJR074W 657 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 KTR1YOR099W 1182 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 ALG5YPL227C 1005 nt5.32□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 SPC97YHR172W 2472 nt5.31□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 HST4YDR191W 1113 nt5.31□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 RPL7AYGL076C 735 nt5.31□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 LCB3YJL134W 1230 nt5.31□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 RPL7BYPL198W 735 nt5.31□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 RPL21AYBR191W 483 nt5.31□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 HAS1YMR290C 1518 nt5.31□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 MTC5YDR128W 3447 nt5.31□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 AMD2YDR242W 1650 nt5.31□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 COR1YBL045C 1374 nt5.3□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 BUG1YDL099W 1026 nt5.3□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.3□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 MRPL24YMR193W 777 nt5.3□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 YTP1YNL237W 1380 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 GPI18YBR004C 1302 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 MMR1YLR190W 1476 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 CLB2YPR119W 1476 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 PGK1YCR012W 1251 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 RAM1YDL090C 1296 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 YDL218WYDL218W 954 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 ASP1YDR321W 1146 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 MTQ1YNL063W 945 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 RPS3YNL178W 723 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 YNL285WYNL285W 372 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 MRPS12YNR036C 462 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 YPR123CYPR123C 435 nt5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms