Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXO4P98177 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FOXO4P98177 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FOXO4P98177 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO4P98177 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXO4P98177 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXO4P98177 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms