Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IRX6P78412 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IRX6P78412 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IRX6P78412 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IRX6P78412 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IRX6P78412 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IRX6P78412 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX6P78412 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX6P78412 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX6P78412 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX6P78412 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX6P78412 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX6P78412 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX6P78412 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX6P78412 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX6P78412 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX6P78412 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX6P78412 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IRX6P78412 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IRX6P78412 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
IRX6P78412 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IRX6P78412 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
IRX6P78412 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IRX6P78412 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
IRX6P78412 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
IRX6P78412 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IRX6P78412 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IRX6P78412 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
IRX6P78412 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IRX6P78412 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IRX6P78412 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IRX6P78412 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IRX6P78412 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
IRX6P78412 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IRX6P78412 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
IRX6P78412 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
IRX6P78412 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IRX6P78412 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IRX6P78412 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IRX6P78412 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IRX6P78412 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IRX6P78412 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
IRX6P78412 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
IRX6P78412 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IRX6P78412 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IRX6P78412 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IRX6P78412 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IRX6P78412 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IRX6P78412 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IRX6P78412 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IRX6P78412 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IRX6P78412 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IRX6P78412 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IRX6P78412 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IRX6P78412 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IRX6P78412 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IRX6P78412 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IRX6P78412 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IRX6P78412 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IRX6P78412 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IRX6P78412 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IRX6P78412 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms