Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT2P78371 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCT2P78371 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCT2P78371 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCT2P78371 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCT2P78371 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCT2P78371 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCT2P78371 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT2P78371 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT2P78371 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCT2P78371 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCT2P78371 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCT2P78371 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCT2P78371 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCT2P78371 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCT2P78371 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCT2P78371 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCT2P78371 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCT2P78371 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCT2P78371 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCT2P78371 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCT2P78371 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT2P78371 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT2P78371 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT2P78371 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT2P78371 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT2P78371 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT2P78371 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT2P78371 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT2P78371 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCT2P78371 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCT2P78371 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT2P78371 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT2P78371 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT2P78371 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT2P78371 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT2P78371 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT2P78371 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT2P78371 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT2P78371 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT2P78371 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT2P78371 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT2P78371 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT2P78371 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT2P78371 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT2P78371 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT2P78371 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT2P78371 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT2P78371 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT2P78371 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCT2P78371 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCT2P78371 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCT2P78371 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCT2P78371 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT2P78371 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT2P78371 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT2P78371 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT2P78371 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT2P78371 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCT2P78371 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCT2P78371 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCT2P78371 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCT2P78371 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCT2P78371 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCT2P78371 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms