Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3EP60228 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms