Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1BP51168 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms