Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTBP49356 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTBP49356 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTBP49356 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTBP49356 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTBP49356 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTBP49356 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTBP49356 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTBP49356 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FNTBP49356 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FNTBP49356 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FNTBP49356 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTBP49356 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTBP49356 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTBP49356 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTBP49356 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTBP49356 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTBP49356 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTBP49356 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTBP49356 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTBP49356 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTBP49356 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTBP49356 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTBP49356 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTBP49356 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTBP49356 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTBP49356 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTBP49356 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTBP49356 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTBP49356 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTBP49356 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTBP49356 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTBP49356 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTBP49356 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTBP49356 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTBP49356 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTBP49356 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTBP49356 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTBP49356 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTBP49356 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTBP49356 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTBP49356 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTBP49356 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTBP49356 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTBP49356 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTBP49356 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTBP49356 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTBP49356 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTBP49356 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTBP49356 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNTBP49356 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNTBP49356 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNTBP49356 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNTBP49356 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNTBP49356 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNTBP49356 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNTBP49356 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNTBP49356 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTBP49356 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTBP49356 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTBP49356 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTBP49356 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTBP49356 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTBP49356 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTBP49356 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTBP49356 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTBP49356 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTBP49356 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTBP49356 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTBP49356 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTBP49356 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTBP49356 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTBP49356 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTBP49356 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTBP49356 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTBP49356 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTBP49356 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTBP49356 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTBP49356 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTBP49356 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTBP49356 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTBP49356 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms