Protein–RNA interactions for Protein: P41968

MC3R, Melanocortin receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC3RP41968 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MC3RP41968 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MC3RP41968 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC3RP41968 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC3RP41968 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC3RP41968 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC3RP41968 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC3RP41968 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC3RP41968 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC3RP41968 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC3RP41968 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC3RP41968 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC3RP41968 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC3RP41968 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC3RP41968 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MC3RP41968 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC3RP41968 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC3RP41968 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC3RP41968 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC3RP41968 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC3RP41968 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MC3RP41968 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC3RP41968 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC3RP41968 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC3RP41968 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC3RP41968 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC3RP41968 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MC3RP41968 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC3RP41968 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC3RP41968 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC3RP41968 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC3RP41968 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC3RP41968 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC3RP41968 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC3RP41968 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC3RP41968 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC3RP41968 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC3RP41968 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC3RP41968 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC3RP41968 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC3RP41968 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MC3RP41968 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC3RP41968 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC3RP41968 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC3RP41968 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC3RP41968 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC3RP41968 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC3RP41968 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC3RP41968 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MC3RP41968 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC3RP41968 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC3RP41968 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC3RP41968 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC3RP41968 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC3RP41968 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC3RP41968 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC3RP41968 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC3RP41968 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC3RP41968 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC3RP41968 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC3RP41968 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MC3RP41968 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MC3RP41968 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MC3RP41968 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MC3RP41968 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MC3RP41968 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MC3RP41968 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MC3RP41968 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC3RP41968 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC3RP41968 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC3RP41968 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC3RP41968 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC3RP41968 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC3RP41968 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC3RP41968 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC3RP41968 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms