Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 CDC16YKL022C 2523 nt6.26□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 ALD6YPL061W 1503 nt6.25□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 SYF2YGR129W 648 nt6.25□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 MNS1YJR131W 1650 nt6.24□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 UGX2YDL169C 672 nt6.24□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 MID1YNL291C 1647 nt6.24□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 ALT2YDR111C 1524 nt6.24□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 JIP4YDR475C 2631 nt6.23□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 YGR127WYGR127W 939 nt6.23□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.23□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 GFD1YMR255W 567 nt6.23□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 PFA3YNL326C 1011 nt6.23□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 VRP1YLR337C 2454 nt6.23□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 PXL1YKR090W 2121 nt6.23□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 MTF2YDL044C 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 HSF1YGL073W 2502 nt6.22□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 IDP1YDL066W 1287 nt6.22□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 YDL144CYDL144C 1071 nt6.22□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 DFM1YDR411C 1026 nt6.22□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 GYP1YOR070C 1914 nt6.22□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.21□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 ENT2YLR206W 1842 nt6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 THI4YGR144W 981 nt6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 VNX1YNL321W 2727 nt6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 VHT1YGR065C 1782 nt6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 SMF2YHR050W 1650 nt6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 ISN1YOR155C 1353 nt6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 RRP46YGR095C 672 nt6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 APS3YJL024C 585 nt6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 SPO7YAL009W 780 nt6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 YPL102CYPL102C 303 nt6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 YER010CYER010C 705 nt6.19□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 CSL4YNL232W 879 nt6.19□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 YBR144CYBR144C 315 nt6.19□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 HIS7YBR248C 1659 nt6.19□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 GDA1YEL042W 1557 nt6.18□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 YLR317WYLR317W 435 nt6.18□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 MLC2YPR188C 492 nt6.18□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 GAA1YLR088W 1845 nt6.18□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 MTC2YKL098W 1074 nt6.17□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 RPS9AYPL081W 594 nt6.17□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 COR1YBL045C 1374 nt6.17□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 AAD15YOL165C 432 nt6.16□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 CHS5YLR330W 2016 nt6.16□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 AMD1YML035C 2433 nt6.16□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 SSK1YLR006C 2139 nt6.16□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 RSC30YHR056C 2652 nt6.15□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.15□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 YDL114WYDL114W 927 nt6.15□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 CBP4YGR174C 513 nt6.15□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 EPS1YIL005W 2106 nt6.15□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 SFC1YJR095W 969 nt6.15□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 CCP1YKR066C 1086 nt6.15□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 CSG2YBR036C 1233 nt6.15□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 ATG12YBR217W 561 nt6.15□□□□□ -1.42
SHQ1P40486 YME1YPR024W 2244 nt6.15□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 MRK1YDL079C 1506 nt6.15□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 GLE1YDL207W 1617 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 SFB3YHR098C 2790 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 TBF1YPL128C 1689 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 LDB19YOR322C 2457 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 DON1YDR273W 1098 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 SNZ3YFL059W 897 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 RRP4YHR069C 1080 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 SNO4YMR322C 714 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 SNZ2YNL333W 897 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 HSP33YOR391C 714 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 HSP32YPL280W 714 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 YFL052WYFL052W 1398 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 TNA1YGR260W 1605 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 HXT17YNR072W 1695 nt6.14□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 PUF3YLL013C 2640 nt6.13□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 SIP2YGL208W 1248 nt6.13□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 CDC11YJR076C 1248 nt6.13□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 RRT2YBR246W 1164 nt6.13□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 SPS22YCL048W 1392 nt6.13□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 RET1YOR207C 3450 nt6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 BZZ1YHR114W 1902 nt6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 GUF1YLR289W 1938 nt6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 CMR1YDL156W 1569 nt6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 MCM6YGL201C 3054 nt6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 YDL119CYDL119C 924 nt6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 IRS4YKR019C 1848 nt6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 PRP46YPL151C 1356 nt6.1□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 PSH1YOL054W 1221 nt6.1□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 ASH1YKL185W 1767 nt6.1□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 CDC19YAL038W 1503 nt6.09□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 VPS70YJR126C 2436 nt6.09□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 YIL077CYIL077C 963 nt6.09□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 GSY2YLR258W 2118 nt6.09□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 RHO2YNL090W 579 nt6.09□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 YBR124WYBR124W 360 nt6.09□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 YEL020CYEL020C 1683 nt6.09□□□□□ -1.43
SHQ1P40486 GEX1YCL073C 1848 nt6.09□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 GEX2YKR106W 1848 nt6.09□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 MSN2YMR037C 2115 nt6.08□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 MDH3YDL078C 1032 nt6.08□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 YPL041CYPL041C 624 nt6.08□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 MSS1YMR023C 1581 nt6.08□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 STL1YDR536W 1710 nt6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms