Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFN2P35080 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFN2P35080 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFN2P35080 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFN2P35080 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFN2P35080 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFN2P35080 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFN2P35080 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFN2P35080 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFN2P35080 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFN2P35080 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFN2P35080 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFN2P35080 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFN2P35080 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFN2P35080 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFN2P35080 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFN2P35080 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFN2P35080 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFN2P35080 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PFN2P35080 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PFN2P35080 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFN2P35080 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFN2P35080 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFN2P35080 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFN2P35080 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFN2P35080 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFN2P35080 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFN2P35080 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFN2P35080 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFN2P35080 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms